האורח משום מה לא הצליח להבהיר את כוונתו:
לא נכנסים כ-root
לסביבה גרפית. אם אתה צריך לבצע פעולה כל שהיא כ-root, בתוך טרמינל ("חלון דוס") כותבים
והופכים ל-root רק בתוך אותו חלון, מבצעים את הפקודה (כגון שינויי ההרשאות) ולסיום לוחצים Ctrl-D כדי לסגור את ה-su.
לגבי הבעיה שתיארת -- אקדמית בלבד, כי, כאמור, לא עובדים ככה -- תסתכל על קבצי האתחול של X (בד"כ xinitrc. או xsession.) בספרית הבית של root. השווה עם משתמש רגיל.