אתה לא צריך להגדיר כלום בתוכנת הטורנט.
אני משתמש (לעיתים די נדירות, אבל עדיין) ב- VPN בעזרת openvpn, כלומר ממש דרך שורת פקודה.
אחרי שהפעלת את השירות, כל תוכנה שתפעיל במחשב (כולל טורנט) תעבור דרך ה- VPN שהפעלת, כל עוד זה פתוח.
"לפי מה שהבנתי הם לכאורה מממנים ארגונים תומכי טרור. ייתכן שאני טועה"
לא יודע מאיפה הבאת את זה. הם בהחלט נגד.
כמובן, כמו כל כלי מוצפן אין להם יכולת לשלוט בתוכן שעובר דרכם. אבל, אם נתיחס לנושא השאלה שלך - VPN - זה נכון לגבי כל ספק vpn.