בעיקרון כן, אבל לא בהחרך שתורגש ירידה בביצועים.
כול זה תלוי בסוג הטכנולוגיה וטכניקות הצפנה שאתה הולך להשתמש בהם.
במערכות מודרניות לרוב מכילות כבר מאיצי הצפנה בתוך החומרה. השאלה עם ההפצה שלך יודעת
לנצל את אותם הרכיבים(אם קימים).
https://en.wikipedia.org/wiki/Cryptographic_accelerator
במעבדים:
https://en.wikipedia.org/wiki/AES_instruction_set
בדסקים קשיחים:
https://en.wikipedia.org/wiki/Hardware-based_full_disk_encryption
כרטיסי הצפנה ייעודי:
https://www.google.co.il/search?q=Cryptographic+accelerator+card&tbm=isch
טבלה עם תכנולוגיות הצפנה:
https://wiki.archlinux.org/index.php/Disk_encryption#Comparison_table
גם אם אין לך מאיץ הצפנה בחומרה שלך כלל. ובהנחה שיש לך שני דיסקים קשיחים, אתה יכול פשוט
להשמש בהצפנת תוכנה ברמת הליבה. להגדיר דיסק שלם אחד עם הצפנה מלאה (בשביל המידע האישי)
ואת שני ללא הצפנה בשביל המערכ\ו\ת הפעלה שלך. זו טכניקה עם ביצועים משופרים לעומת שאר
השיטות לרוב.
בהצלח.